原因の一つとして考えられるのは、
自転車のペダルを踏む時の、
足の筋肉の使い方になります。

普通の歩行とは違い、
回転運動になりますから、

○　ふくらはぎの筋肉が力を失い細くなり
○　太ももの筋肉が反対に太くなります。

結果として、
猫背気味になり、
姿勢を崩す事になります。
また、
サドルが骨盤の坐骨を外側に開く事になります。

https://www.youtube.com/watch?v=w0hxR6zj8jY&feature=youtu.be

痛みとツボについて回答します。昨日はツボ反応とだけ答えましたがツボに反応が出るとその周辺の組織が弱り骨に変形が出ます。変形も傾きがあればレントゲンで分かりますが回転の変形は形に出ないので分かりにくいのです。回転すると神経が通る道が狭くなるので神経に触れやすくなります。そしてかいてんして、支えている筋肉があるために開店すると間隔が狭くなり軟骨が周りに押し出され神経に触れやすくなると考えます。軟骨が減ったように見えるのはこの事と私は考えています。ですからあなたの痛みはツボのところにある変形が原因だと私は考えます。ツボ反応が消えれば変形も改善するでしょう。

＞背中を曲げると背骨の真ん中ぐらい(おへそと同じぐらいの高さ？)が痛みます。

腰椎の１番２番あたりですね。

痛みの原因は、ヘルニアか腰椎の歪みになりますが、
ヘルニア名場合、痛みにむらが出にくいです。
したがって腰椎の歪みが一番疑われます。



歪んでる骨は痛みを感じます。
ゆがみを矯正すると、痛みは改善しています。

http://chirooste.com/article/detail.php/190/301339

まずは朝起きたときにもっとも痛むということも考えると筋肉の硬直によって起こる可能性ももちろんあります。
では、原因は果たしてそれだけでしょうか
ご自分でできるテストをしてみましょう。
まずあおむけで寝てください。
足も両方伸ばします。
その後片足ずつ膝を伸ばした状態で上に上がるところまで上げてみましょう。
どうでしょうか、どちらかの足のほうが上がりにくいなんてことはありませんでしたか？もしもあったのなら仙腸関節というところの動きが悪くなっている可能性があります。AKA法という治療ができる整骨院は限られていますがそこに行くと改善されると思います。
あともう一つ原因を考えると胸椎の動きの悪さも考えられます。
そこも踏まえて仙腸関節と胸椎の動きの改善のできる整体院や整骨院に行かれるとよいでしょう。

お答えします。質問を読んで痛みの位置が胃や十二指腸のツボがあるところだと思います。そこに無理をしていると考えます。食事やストレスがないかを考えて改善すると良いと思いと思います。薬を使うことも私は大切だと思います。

見て判断します。
自然療法整体治療院ときわ台健康堂　院長抄明
ヘルニア編　:　http://www.geocities.jp/hsclinc39/heruniya/heriniya.html

お体を拝見していないので何とも言えませんが、朝痛く、日中は痛くないということを考えると「筋肉の緊張」が原因かと思います。

起床してから体を動かすうちに筋肉が多少緩んでくるんだと思います。

神経圧迫の場合ですと、常時痛みが出ていないと辻褄が合わなくなります。
痛みがある時だけ神経が圧迫されて、痛みがない時は神経が圧迫されないことは矛盾していますし、そんなに人間の骨格はすぐに変化しないと思います。

お力になれる意見かは分かりませんが、ご参考にしていただけたら幸いです。

筋肉の張り
筋膜のかたさにより
痛みが出てもおかしくありません

触るだけでも痛みが出ることもありますが
筋膜リリースや筋肉調整で
その痛みはなくなるとは思います